可能です。
デバイスマネージャーで"IXXAT CAN-Interfaces"と表示されているものは、VCI V2ドライバーが割り当てられているCANインターフェイスです。
"IXXAT VCI V3 Interfaces"と表示されているものはVCI V3ドライバーが割り当てられているCANインターフェイスです。

VCI V2とVCI V3の変更方法については、VCI V3のインストールマニュアルをご覧ください。